Caracterização de genótipos de gergelim utilizando RAPD e microssatélte

Abstract

O gergelim (Sesamum indicum L.) é uma espécie oleaginosa, adaptada às condições edafoclimáticas das regiões tropicais. Por ser um alimento de elevado valor nutricional e econômico, há um mercado crescente para exploração de seus grãos e óleo, que podem ser usados nas indústrias oleoquímica, alimentar, farmacêutica e cosmética e até para o segmento biodiesel. Estudos de caracterização da diversidade genética podem promover a identificação de genótipos desejáveis por suas características per se e/ou por meio de hibridação de características desejáveis, como indeiscência de cápsulas, tolerância a doenças e produtividade. Objetivou-se, com esse trabalho, identificar por meio de técnicas de RAPD (Random Amplication of Polymorphic em DNA) e microssatélite (SSR), genótipos de gergelim com características de indeiscência ou semideiscência, agrupando os genótipos quanto à indeiscência dos frutos e identificando nos genótipos estudados fontes de genes capazes de expressar características de indeiscência dos frutos. Para realização deste trabalho, 68 genótipos de gergelim foram cultivados em casa de vegetação na sede da Embrapa Algodão, Campina Grande, PB. Amostras de tecidos foliares foram coletadas e utilizadas para a extração do DNA genômico de acordo com o protocolo CTAB (Brometo de Cetiltrimetilamônio), com modificações. A relação genética entre os 68 genótipos de gergelim foi avaliada por meio de PCR (Reação em Cadeia da Polimerase), utilizando-se o primer C19 do tipo RAPD e nove primers para microssatélites e o programa Genes para análise da diversidade genética. As análises de diversidade foram feitas com base nas estimativas de distância genética de complemento aritmético do coeficiente de Jaccard e para representação dos grupos de genótipos utilizou-se o agrupamento pelo método de otimização de Tocher, o método hierárquico UPGMA e a projeção das distâncias num plano tridimensional a fim de facilitar a identificação entre os acessos de acordo com o grau de dissimilaridade. As reações utilizando o primer C19, geraram 282 bandas polimórficas, de aproximadamente 750 a 2.000 pares de base, enquanto que 132 alelos foram observados nas reações de microssatélites. Os diferentes métodos de agrupamento a partir de marcadores RAPD destacaram os genótipos CNPA-SH 14, CNPA-SH 19, CNPA-SH 46, CNPA-SH 50, CNPA-SH 51 e CNPA-SH 68, como mais divergentes e com a presença da banda associada à indeiscência dos frutos. A partir dos resultados obtidos pelos métodos de agrupamento Tocher e dispersão gráfica, utilizando os dados obtidos pelos marcadores microssatélites, constatou-se que os genótipos CNPA-SH 24, CNPA-SH 35, CNPA-SH 36, CNPA-SH 38, CNPA-SH 40, CNPA-SH 42 e o CNPA-SH 45, apresentaram-se como mais divergentes. A partir dos marcadores moleculares constatou-se baixa divergência genética entre os genótipos de gergelim estudados. No entanto, dentre os genótipos analisados o CNPA-SH 68 apresentou marcas RAPD em associação a características fenotípica de indeiscência dos frutos.